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Plateforme 3D-ONCO

Les modèles 3D 🧫

 Les modèles cellulaires expérimentaux
constituent des outils essentiels
en recherche fondamentale et
translationnelle, notamment pour
l’étude des mécanismes tumoraux
et l’évaluation de nouvelles
stratégies thérapeutiques.

Le développement des modèles in vitro tridimensionnels (3D), permet de reproduire plus fidèlement l’architecture et certaines fonctionnalités des tissus d’origine. Les approches récentes, intégrant notamment des co-cultures cellulaires et des dispositifs de micro-fluidique, visent à mieux reproduire la complexité du micro-environnement tumoral et à renforcer la pertinence de ces modèles pour la recherche en oncologie.

La plateforme 3D-ONCO, a pour objectif de mettre à disposition de la communauté académique et aux industriels son expertise centrée autour de ces modèles 3D. Les axes majeurs de cette offre passent par la production, la caractérisation et la constitution de banques de modèles 3D « ready-to-use », robustes et standardisés, issus de différentes indications de cancer ou de tissus sains, ainsi qu’un panel de services associés. Elle propose également le développement de protocoles permettant l’adaptation et la complexification des modèles existants. Pour cela, nous assurons la gestion du projet et les interactions, administratives et expérimentales, en lien étroit avec les autres plateformes du CRCL.

Pour toute demande de projet : 3Donco@lyon.unicancer.fr

Dernières actualités

Expertises et savoir faire 🧬

Notre spécificité

Nous bénéficions, grâce à un partenariat contractualisé avec le Centre Léon Bérard, les Hospices Civils de Lyon et Infirmerie Protestante, d’un accès à un large panel d’échantillons de tissus frais de patients.

L’ensemble des échantillons biologiques et des données associées est collecté, traité et transféré dans le strict respect de la réglementation en vigueur. Ces activités sont menées en étroite collaboration avec le CRB PGEB du Centre Léon Bérard (BB-0033-00050, certifié ISO 20387) et le CRB Tumorothèque Est des Hospices Civils de Lyon (BB-0033-00046, certifié ISO 20387). Les collections biologiques, leurs dérivés (CODECOH) ainsi que les traitements de données associés font l’objet des déclarations réglementaires requises auprès de la CNIL (méthodologie de référence MR-004). Ces déclarations sont validées par le ministère chargé de la Recherche, garantissant la conformité éthique et réglementaire des activités de la plateforme.

 

Production des modèles 3D

  • Étape 1 : Accompagnement à la conception et au montage de projets de recherche, incluant l’aide à la rédaction de demandes de financement, la mise en place de protocoles cliniques dédiés et l’organisation des circuits de prélèvement associés
  • Étape 2 : Définition et optimisation des conditions de préparation, d’isolement et de culture adaptés aux différents types tumoraux
  • Etape 3 : Prise en charge et traitement des échantillons tissulaires frais pour l’établissement et la production en routine de modèles 3D.

 

Caractérisation des modèles 3D

La caractérisation histologique et moléculaire sont réalisées en collaboration avec la PAR du CRCL et le service d’ACP des HCL.

Cette prestation inclut la réalisation de colorations histologiques, d’analyses immunohistochimiques et de séquençage de panels de gènes par NGS, à l’aide de panels comparables à ceux utilisés pour le diagnostic clinique. L’interprétation des résultats est assurée et validée par un médecin anatomopathologiste.

 

Utilisation des modèles 3D

→ Évaluation de la réponse aux traitements (chimiothérapies conventionnelles ou en développement, ADC … ), détermination d’IC50 par imagerie (suivi en temps réel) et tests de viabilité (longitudinal et point final)…

→ Imagerie sur modèles fixés (coupes FFPE, cryostat ou in toto) et sur modèles 3D vivants in toto

→ Utilisation dans le cadre de différents readouts (cytométrie, scRNAseq, protéomique, matrisome, sécrétome …)

 

Tests EX VIVO

Les tests prédictifs ex vivo (organotypiques) sur coupes épaisses (200 µm) de tissus frais de patients permettent d’étudier la réponse à des composés sur une tumeur intacte, en conservant son architecture et les interactions avec son micro-environnement. Les coupes peuvent être analysées après fixation par imagerie ou après dissociation par cytométrie, scRNAseq …

 

Formation

La plateforme propose des formations à la demande sur la production, le traitement et l’analyse des modèles 3D, destinées aux techniciens, ingénieurs, doctorants et chercheurs des secteurs académique et privé. Les responsables de la plateforme vous accompagnent dans la définition du format de formation le plus adapté à vos besoins.

Elle intervient également dans le cadre des cursus universitaires, ainsi qu’auprès d’autres structures de formation sous forme de cours, conférences ou visites.

Enfin, la plateforme organise deux sessions annuelles de formation en partenariat avec le CNRS Formation Entreprises, dédiées aux cultures cellulaires 3D, organoïdes et modèles humains complexes. En savoir plus

 

Citez-nous dans vos publications !

Afin de permettre à notre plateforme de poursuivre ses objectifs, nous avons besoin que vous mentionniez notre travail dans vos publications de la manière suivante :

Plateforme 3D-ONCO, Université de Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, INSERM 1052, CNRS 5286, Centre Léon Bérard, Centre de recherche en cancérologie de Lyon (CRCL), Lyon, 69373, France